Krill antartico, sequenziato il suo genoma per la prima volta ed è 15 volte quello umano: lo studio internazionale a cui a partecipato anche l'Università di Padova
Padova, 23 marzo 2023 – Una sorprendente notizia coinvolge l’Università di Padova: è stato sequenziato il genoma immenso del krill antartico, è 15 volte quello umano ed è il più grande di tutto il mondo animale mai sequenziato fino ad ora.
Lo studio internazionale, pubblicato su Cell e che vede la firma dei ricercatori dell'ateneo patavino, aiuterà a comprendere tra le altre cose anche gli effetti del riscaldamento globale. Vediamo di cosa si tratta.
Che cos’è il krill antartico
Il krill antartico (Euphausia superba) è l’organismo animale più abbondante sul pianeta, con una biomassa totale compresa tra i 300 e i 500 milioni di tonnellate. Questo piccolo gamberetto riveste un ruolo vitale per l’ecosistema antartico poiché rappresenta il principale collegamento tra i produttori primari che compongono il fitoplancton e i livelli più alti della catena alimentare nutrendo uccelli marini, foche, pinguini e balene.
Grazie alla sua enorme biomassa, il krill incide in modo significativo su fondamentali processi biogeochimici globali, quali i cicli del carbonio e il riciclo del ferro: per questa ragione, studiarne la biologia e comprenderne le potenzialità di adattamento a un ambiente in continua evoluzione a causa degli effetti del riscaldamento globale risulta, quindi, fondamentale.
Il genoma più grande mai sequenziato
Il genoma è l'insieme del patrimonio genetico che caratterizza ogni organismo vivente, una specie di un manuale di istruzioni che dirige lo sviluppo di un organismo e poi il suo funzionamento. Fino ad ora, l’impossibilità di ricostruire la sequenza del genoma di krill – ben 15 volte più grande di quello umano – ha rappresentato un ostacolo tecnico insormontabile per l’approfondimento degli aspetti fisiologici, molecolari e genetici del krill.
La ricerca, “The enormous repetitive Antarctic krill genome reveals environmental adaptations and population insights”, pubblicata su Cell e firmata da Changwei Shao del Yellow Sea Fisheries Research Institute di Qingdao, è stata realizzata in collaborazione con un team di ricercatori del Dipartimento di Biologia dell’Università di Padova.
Grazie alle più innovative tecnologie di sequenziamento e ai più aggiornati metodi di analisi è stato possibile ricostruire per la prima volta l’intero genoma di krill che risulta essere il più grande di tutto il mondo animale mai sequenziato fino ad ora.
L’immenso Krill
Le sue enormi dimensioni sembrano essere il risultato della duplicazione e spostamento di numerosi segmenti di Dna – gli elementi trasponibili – in posizioni diverse del genoma, e non di duplicazioni dell’intero genoma, come osservato in altre specie. In particolare, sono stati identificati due eventi recenti di accumulo degli elementi trasponibili, collegati entrambi a cambiamenti climatici, che potrebbero essere responsabili delle attuali grandi dimensioni del genoma.
Dove si trova
"Il krill si estende dal circolo polare antartico fino alle coste meridionali dell’America latina e dell’Australia: questi ambienti sono caratterizzati da condizioni ambientali molto diverse, soprattutto in termini di temperatura, fotoperiodo e disponibilità di cibo. Questa elevata distribuzione geografica è dovuta alle grandi capacità adattative che il krill ha sviluppato per vivere in un ecosistema, quello antartico, soggetto a variazioni estreme nel corso dell’anno; si pensi ad esempio al ciclo stagionale della banchisa o alla notte polare” spiega Cristiano De Pittà, co-autore dello studio dell’Università patavina.
Un crostaceo dalle grandi capacità adattive
“In tal senso, un ruolo fondamentale è svolto dall’orologio circadiano che controlla a livello molecolare l’espressione ritmica giornaliera e stagionale di numerosi geni – continua Alberto Biscontin, co-autore dello studio e ricercatore dell’Università di Padova al momento della ricerca –. Il sequenziamento del genoma ha permesso di identificare 625 geni la cui espressione risulta essere sotto il controllo diretto dell’orologio endogeno e potrebbero, quindi, rappresentare il fulcro del processo di adattamento fisiologico e comportamentale di questo organismo alle estreme variazioni stagionali a cui è sottoposto”.
Le popolazioni ancestrali del Krill antartico
La presenza della corrente circumpolare antartica (Acc), inoltre, è responsabile di altissimi livelli di connettività tra le diverse aree geografiche. Per anni la popolazione di krill antartico è stata ritenuta geneticamente omogenea.
Ma il sequenziamento del genoma ha portato all’identificazione di milioni di nuovi marcatori genetici (Single Nucleotide Polymorphisms) che hanno permesso, per la prima volta, di eseguire una completa analisi della struttura della popolazione di krill antartico, mettendo in luce le tracce genetiche di quattro diverse popolazioni ancestrali ancora presenti in krill provenienti da altrettante regioni geografiche.
“Il genoma di Euphausia superba, oltre ad essere una sfida tecnologica vinta, riapre il dibattito sul significato biologico dei grandi genomi e rappresenta una preziosissima risorsa che fornirà nuovi e importanti elementi per una comprensione sempre maggiore della biologia e del ruolo ecologico di questa specie” conclude Gabriele Sales, anche lui co-autore dello studio dell’ateneo di Padova.